Seth Green urodził się i wychowywał w Overbrook Park w Pennsylvanii. Jego ojciec Herb był nauczycielem matematyki, a matka Barbara - artystką.
W młodości Seth uczęszczał do szkoły publicznej, gdzie dużo grał w piłkę nożną. O tym, że chce być aktorem zadecydował już w wieku sześciu lat.